Vienmēr ir tie, kas cenšas savaldīt un notvert retos pokemonus, un ir tādi, kas aizsargās šos īpašos pokemonus no ļaunajiem spēkiem. Pirms četrdesmit gadiem tieši tas notika, kad Selebija atklāja, ka bēg no ļaunā mednieka, un palīgā steidzās jauns treneris vārdā Samijs. Viņi pazuda, kļūstot par vēl vienu dīvainu leģendu, ko stāsta pilsētnieki.

Mūsdienās Ešs un draugi ierodas mežā, un, lai gan stāsts par Samiju un Selebiju sākumā varētu šķist tieši tāds — stāsts —, viņi uzzina patiesību, kad zēns un pokemons atkal parādās! Lai gan abi atgūstas no mokošā pārbaudījuma, kas ilgs četrdesmit gadus, lietas ne vienmēr uzlabojas — joprojām ir cilvēki, kas vēlas notvert Selebiju! Šoreiz tas ir Dzelzs masku marodieris, un viņa plāns varētu būt pagaidām nežēlīgākais. Viņš ir aprīkots ar Dark Balls, kas padara ikvienu tajās sagūstīto pokemonu bezprātīgi paklausīgu un ļaunu. Vai Ešs, Semijs, Mistija un Broks spēj izturēt apsēstā Selebija spēku un atjaunot to līdz patiesajam es?