Iori Kitahara pārceļas uz piekrastes pilsētu Izu, lai studētu universitātē pirmo gadu, apmetoties virs sava tēvoča niršanas veikala “Grand Blue”. Iori lolo lielas cerības un sapņus par ideālu koledžas pieredzi, taču, ieejot veikalā, viņu ierauj bezrūpīgo Niršanas kluba biedru alkoholiskajās aktivitātēs, kuri tur bieži uzturas. Vecāko klašu skolēnu Šindži Tokitas un Rjūdžirou Kotobuki pierunāts, Iori negribīgi pievienojas viņu dīvainajai ballītei. Vēlāk ienāk viņa māsīca Čisa Kotegava un pieķer viņu darbībā, izpelnoties Iori pilnīgu nicinājumu.

Bērnam Aojamai ir zināšanas, kas salīdzināmas ar pieaugušo. Tāpēc klasesbiedri viņu bieži ķircina. Viņam ir arī simpātijas pret draudzīgo sievieti, kuru viņš nesen satika zobārstniecības kabinetā. Kādu rītu viņa apkārtnē mistiski sāk parādīties pingvīni. Neviens nezina, no kurienes viņi nāca un kā viņiem izdevās tur nokļūt. Aojama ir apņēmības pilna uzzināt vairāk, un viņš pievienojas savai jaunajai simpātijai pingvīnu izpētē. Laikam ejot, viņi atklāj levitējošu sfēru, ko viņi sauc par “Jūra”. Viss, kas nonāk jūrā, neatgriežas, un vienīgie, kas to var iznīcināt, ir pingvīni. Tomēr, kad pingvīni dara, tiek radīts kaut kas šausminošs… Pingvīnu lielceļš seko Aajamai un sievietes pētījumiem par noslēpumaino pingvīnu izcelsmi, kā arī daudzajām grūtībām, ar kurām Aojama saskaras izmeklēšanas laikā.